Danonen oma tutkimuskeskus Centre Daniel Carasso, Danone-Instituutit sekä kliinisten tutkimusten yhteistyötahot takaavat monipuolisen tutkimustoiminnan eri puolilla maailmaa. Danone-Instituutit ovat itsenäisiä, voittoa tavoittelemattomia yksiköitä, joita paikalliset Danone-yhtiöt rahoittavat. Instituutin jäsenet valitaan paikallisesta tieteellisestä yhteisöstä.

Viimeisen 17 vuoden aikana Danone-Instituutit ovat tukeneet yli 850 tutkimusprojektia ja jakaneet yli 17 miljoonaa euroa tutkimukseen. Ne ovat järjestäneet 86 symposiumia tai työpajaa, 178 tieteellistä konferenssia ja ammattilaisten koulutusohjelmaa ja perustaneet 10 jatkuvaa koulutusohjelmaa terveydenhuollon ammattilaisille. Lisäksi ne ovat julkaiseet lähes 90 kirjaa ja 10 paikallista uutiskirjettä sekä perustaneet yli 70 koulutusohjelmaa suurelle yleisölle.