Danonen tarina alkaa Barcelonassa vuonna 1919. Jo silloin yrityksen toiminta tähtäsi terveyden edistämiseen. Ensimmäiset Danonen jogurtit valmistettiin Pasteur Instituutista saadusta hapatetusta maidosta ja niitä myytiin apteekeissa Barcelonassa. Jogurttia käytettiin lääkkeenä suolistotulehduksiin, joita esiintyi ensimmäisen maailmansodan jälkeen erityisesti lapsilla. Siitä lähtien Danone on kerännyt bakteerikantoja, joita yhtiö onkin tunnistanut 3 500 kappaletta. Niistä 50 on käytössä Danonen tuotteissa.

Danonen terveysvaikutteisten jogurttien merkittävimmät probioottibakteerit kuuluvat Bifidus- ja Lactobacillus-sukuihin. Niistä on tehty yhteensä yli 40 kliinistä tutkimusta (17 Bifidobacterium lactis DN-173010:lla ja 26 Lactobacillus casei DN-114001:lla) sekä useita prekliinisiä tutkimuksia.

Danone on sitoutunut työskentelemään kuluttajien terveyden ja hyvinvoinnin edistämiseksi. Neljä viidestä Danonen tutkimusprojektista keskittyy terveyteen ja ravitsemukseen.Tutkimus- ja kehityskeskus Centre Daniel Carasso Pariisissa selvittää yhteistyössä maailman johtavien ravitsemusasiantuntijoiden kanssa eri raaka-aineiden, ravintoaineiden ja ruokatottumusten vaikutuksia terveydelle.